Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptpn9O35239 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms