Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pitx3O35160 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms