Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm6871L7N248 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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