Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm2056J3QQ02 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms