Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alkal1J3QPP8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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