Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5225J3QPL3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5225J3QPL3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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