Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
BC024978J3QPC3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms