Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim22J3QP37 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms