Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms