Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms