Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sclt1G5E861 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sclt1G5E861 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sclt1G5E861 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sclt1G5E861 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sclt1G5E861 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sclt1G5E861 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sclt1G5E861 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sclt1G5E861 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sclt1G5E861 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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