Protein–RNA interactions for Protein: G3X9D6

Apon, Apolipoprotein N, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AponG3X9D6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AponG3X9D6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AponG3X9D6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AponG3X9D6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AponG3X9D6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AponG3X9D6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AponG3X9D6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AponG3X9D6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AponG3X9D6 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms