Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20517G3UVU6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms