Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms