Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm28048F7BCN0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm28048F7BCN0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm28048F7BCN0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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