Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm8005F6YKY3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm8005F6YKY3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm8005F6YKY3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm8005F6YKY3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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