Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC067074F6RXI4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms