Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga10E9Q6R1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms