Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms