Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rnf217D3YYI7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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