Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms