Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syce3B5KM66 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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