Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms