Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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