Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms