Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms