Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms