Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms