Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms