Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Atp8b5A3FIN4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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