Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn3aA2ASI5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms