Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp8nlA2ABX0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms