Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PtprfA2A8L5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms