Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms