Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Mrpl40Q9Z2Q5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Mrpl40Q9Z2Q5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Mrpl40Q9Z2Q5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Mrpl40Q9Z2Q5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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