Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ccl8Q9Z121 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl8Q9Z121 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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