Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms