Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnip1Q9WUU8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms