Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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