Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cry2Q9R194 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms