Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav3Q9R0C8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vav3Q9R0C8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms