Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms