Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tomm40Q9QYA2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tomm40Q9QYA2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms