Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms