Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms