Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms