Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc5Q9QX29 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms