Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Homer2Q9QWW1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Homer2Q9QWW1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Homer2Q9QWW1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Homer2Q9QWW1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Homer2Q9QWW1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Homer2Q9QWW1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Homer2Q9QWW1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Homer2Q9QWW1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Homer2Q9QWW1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Homer2Q9QWW1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Homer2Q9QWW1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms