Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tnfrsf19Q9JLL3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tnfrsf19Q9JLL3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tnfrsf19Q9JLL3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfrsf19Q9JLL3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfrsf19Q9JLL3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfrsf19Q9JLL3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms