Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tlr5Q9JLF7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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